首页

在Windows上通过WSL使用Claude Code与RStudio

你在Windows上安装了RStudio用于运行R代码，在WSL中安装了Claude Code用于AI辅助编程。本教程将展示如何在同一个项目文件上同时使用这两个工具。你将在Windows中创建R项目，手动编写一些代码，然后从Ubuntu终端使用Claude Code来增强代码，添加可视化和分析功能——同时保持RStudio打开以运行和测试代码。

核心概念

• WSL (Windows Subsystem for Linux) - 在Windows内运行Ubuntu Linux，Claude Code安装在其中
• 文件路径转换 - Windows路径如C:\Users\YourName\Documents在WSL中变成/mnt/c/Users/YourName/Documents
• 混合工作流 - RStudio (Windows)运行代码；Claude Code (WSL)编写和改进代码

所需准备

• 已完成在Windows上安装Claude Code指南
• 在Windows上安装了RStudio
• 20-30分钟

步骤1：在Windows上打开RStudio

• 点击Windows开始按钮
• 在搜索框中输入RStudio
• 点击RStudio打开它
• RStudio窗口打开，显示多个面板

步骤2：创建新的R项目

• 在RStudio中，点击顶部菜单的File
• 点击New Project…
• 选择New Directory
• 选择New Project
• 在Directory name中输入：test_claude
• 点击”Create project as subdirectory of:”旁边的Browse
• 导航到Documents文件夹
• 点击Select Folder
• 点击Create Project
• RStudio创建项目并切换到该项目

步骤3：创建新的R脚本

• 在RStudio中，点击File > New File > R Script
• 左上角面板中打开一个新的空白脚本
• 点击File > Save（或保存图标）
• 将文件命名为：iris.R
• 点击Save

步骤4：手动编写初始代码

在iris.R文件中输入以下代码：

data(iris)
str(iris)
summary(iris)

• 点击File > Save保存更改
• 要运行代码：选中所有行，然后点击Run按钮（脚本面板右上角）
• 应该在Console面板中看到输出，显示数据集结构和统计信息

步骤5：打开Ubuntu Terminal

• 点击Windows开始按钮
• 在搜索框中输入Ubuntu
• 点击Ubuntu（橙色圆形图标）
• Ubuntu终端打开

步骤6：导航到项目文件夹

• 在Ubuntu终端中，输入以下命令（将YourUsername替换为你的实际Windows用户名）：

  cd /mnt/c/Users/YourUsername/Documents/test_claude
  

• 要查找用户名，可以输入：ls /mnt/c/Users/并查找你的文件夹名称
• 通过输入以下命令验证位置是否正确：

  ls
  

• 应该看到列出了iris.R和test_claude.Rproj

步骤7：启动Claude Code

• 在Ubuntu终端中，输入：

  claude
  

• Claude Code启动并显示欢迎消息
• 可能需要重新登录——请参阅在Windows上安装Claude Code指南了解身份验证步骤
• 现在已准备好为R项目使用AI辅助

步骤8：请求Claude创建散点图

如果Claude Code运行缓慢或无响应，只需等待它初始化。然后，输入以下请求：

在 iris.R 中添加代码，创建萼片长度与宽度的散点图，按物种着色。使用 ggplot2。

• Claude Code将读取iris.R文件并添加可视化代码
• 被询问时，通过选择适当的选项授予Claude编辑iris.R文件的权限
• 等待Claude完成（将看到确认消息）

步骤9：在RStudio中运行新代码

• 切换回RStudio（点击RStudio窗口）
• 可能会看到提示说文件已更改——点击Yes重新加载
• 如果没有出现提示，点击File > Reopen with Encoding > UTF-8
• 选中所有代码并点击Run
• 散点图出现在Plots面板（右下角）
• 如果出现关于ggplot2的错误，在Console面板中输入install.packages("ggplot2")来安装它

步骤10：优化散点图

• 切换到Ubuntu终端
• 输入以下请求：

  移除标题。按物种更改标记类型。更改为 classic 主题。
  

步骤11：查看优化后的图表

• 切换到RStudio
• 如果出现提示，重新加载文件
• 选中更新后的代码并点击Run
• 图表现在应该显示为没有标题，每个物种使用不同的标记形状，并使用经典主题

步骤12：请求Claude创建PCA图

• 切换到Ubuntu终端
• 输入以下请求：

  添加代码对数值变量进行 PCA 分析，并使用前两个主成分绘制样本图。
  

步骤13：运行PCA分析

• 切换到RStudio
• 如果出现提示，重新加载文件
• 选中所有代码并点击Run
• 出现PCA图，显示样本投影到PC1和PC2上，按物种着色

步骤14：请求Claude审查并添加注释

• 切换到Ubuntu终端
• 输入以下请求：

  检查整个脚本的正确性。必要时添加注释。
  

• Claude将审查代码并添加全面的注释

步骤15：请求Claude创建R Markdown

• 切换到Ubuntu终端
• 输入以下请求：

  为这个分析创建一个新的 R Markdown 文件。保存为 iris_report.Rmd
  

• Claude将请求你的权限来创建此文件
• Claude将在项目文件夹中创建一个新的.Rmd文件

步骤16：编织R Markdown文件

• 切换到RStudio
• 点击File > Open File…
• 选择iris_report.Rmd并点击Open
• 点击脚本面板顶部的Knit按钮（带有毛线球图标）
• RStudio将生成HTML报告
• 报告在新窗口中打开，显示完整分析和叙述文本
• HTML文件保存在项目文件夹中

故障排除

• 从WSL访问Windows文件时”Permission denied” - 确保使用/mnt/c/而不是C:/。检查路径中的用户名是否正确。
• RStudio不显示文件更改 - 点击File > Reopen with Encoding > UTF-8手动重新加载文件。
• “claude: command not found” - 确保已完成安装指南。尝试打开一个新的Ubuntu终端窗口。
• 图表未显示 - 确保已安装ggplot2。如需要，在RStudio Console中运行install.packages("ggplot2")。
• 错误：”cannot change working directory” - Windows路径包含空格。在步骤6中，将路径用引号括起来：cd "/mnt/c/Users/Your Name/Documents/test_claude"
• Claude Code首次请求时很慢 - 等待30-60秒让Claude初始化。后续请求会更快。

下一步

• 尝试请求Claude向分析添加统计检验（t检验、ANOVA）
• 请求Claude获取此代码的Python版本并准备一个Quarto文档
• 请求Claude为R脚本中的重复性任务创建函数
• 使用Claude在R代码无法运行时调试错误消息
• 探索请求Claude优化运行缓慢的R代码以获得更好的性能

工作流总结

这种混合设置结合了两全其美：

• RStudio (Windows) - 交互式R控制台、即时图表查看、用于运行代码的熟悉GUI
• Claude Code (WSL) - AI驱动的代码生成、审查和改进
• 共享文件 - 两个工具通过WSL的/mnt/c/挂载点在同一文件上工作
• 迭代优化 - 从手动代码开始，用Claude增强，在RStudio中测试，然后进一步优化
• 文档 - Claude可以为分析生成全面的报告和注释

工作流程很简单：在Ubuntu终端中使用Claude编写或编辑代码，然后立即在RStudio中测试和运行。无需文件复制或手动同步——WSL和Windows无缝共享同一文件。

由Steven Ge创建于2025年12月11日。