在 Mac 上使用 Claude Code 与 RStudio
你在 Mac 上拥有 RStudio 来运行 R 代码，同时拥有 Claude Code 来获得 AI 驱动的编码辅助。本教程将展示如何将两个工具一起用于同一项目文件。你将创建 R 项目，手动编写代码，然后从 Terminal 使用 Claude Code 通过可视化和分析增强它——同时 RStudio 保持打开以运行和测试代码。
关键概念
- Terminal - Mac 命令行界面，Claude Code 在此运行
- 共享文件 - RStudio 和 Claude Code 都处理 Documents 文件夹中的相同文件
- 混合工作流 - RStudio 运行代码，Claude Code 编写和改进代码
准备工作
- 完成 在 Mac 上安装 Claude Code
- Mac 上已安装 RStudio
- 20-30 分钟
步骤 1：在 Mac 上打开 RStudio
- 点击 Dock 中的 Launchpad（网格点图标）
- 在搜索框中输入
RStudio - 点击 RStudio 打开
- RStudio 窗口打开，显示多个窗格
步骤 2：创建新的 R 项目
- 在 RStudio 中，点击 File > New Project…
- 选择 New Directory
- 选择 New Project
- 在 Directory name 中输入：
test_claude - 点击”Create project as subdirectory of:”旁边的 Browse
- 导航到 Documents 文件夹
- 点击 Open
- 点击 Create Project
- RStudio 创建项目并切换到此项目
步骤 3：创建新的 R 脚本
- 在 RStudio 中，点击 File > New File > R Script
- 新空脚本在左上方窗格中打开
- 点击 File > Save（或按 Command (⌘) + S）
- 命名文件为：
iris.R - 点击 Save
步骤 4：手动编写初始代码
在你的 iris.R 文件中输入这段代码：
data(iris)
str(iris)
summary(iris)
- 点击 File > Save 保存更改（或按 Command (⌘) + S）
- 运行代码：选中所有行，点击 Run 按钮（脚本窗格右上方）
- 你应在 Console 窗格中看到数据集结构和统计信息的输出
步骤 5：打开 Terminal
- 打开 Finder 并点击左侧边栏中的 Applications
- 打开 Utilities 文件夹
- 双击 Terminal
- Terminal 窗口打开
步骤 6：导航到你的项目文件夹
- 在 Terminal 中，输入这个命令：
cd ~/Documents/test_claude - 输入以下命令验证位置正确：
ls - 你应看到列出的
iris.R和test_claude.Rproj
提示： 如不确定确切路径，可将文件夹从 Finder 拖放到 Terminal 中，完整路径将自动出现。
步骤 7：启动 Claude Code
- 在 Terminal 中输入：
claude - Claude Code 启动并显示欢迎消息
- 如果是首次会话，可能需要进行身份验证
- 现在可以为 R 项目使用 AI 辅助
步骤 8：请求 Claude 创建散点图
如果 Claude Code 较慢或无响应，等待它初始化。然后输入请求：
在 iris.R 中添加代码，创建萼片长度与宽度的散点图，按物种着色。使用 ggplot2。
- Claude Code 读取
iris.R文件并添加可视化代码 - 询问时，通过选择适当选项给 Claude 权限编辑 iris.R 文件
- 等待 Claude 完成（你会看到确认消息）
步骤 9：在 RStudio 中运行新代码
- 切换回 RStudio（点击 RStudio 窗口或按 Command (⌘) + Tab）
- 可能会看到文件已更改的提示，点击 Yes 重新加载
- 如无提示，点击 File > Reopen with Encoding > UTF-8
- 选中所有代码，点击 Run
- 散点图出现在 Plots 窗格（右下方）
- 如收到 ggplot2 错误，在 Console 窗格输入
install.packages("ggplot2")安装
步骤 10：优化散点图
- 切换到 Terminal（按 Command (⌘) + Tab 或点击 Terminal 窗口）
- 输入这个请求：
移除标题。按物种更改标记类型。更改为 classic 主题。
步骤 11：查看优化后的图表
- 切换到 RStudio
- 如有提示，重新加载文件
- 选中更新的代码，点击 Run
- 图表现在显示无标题，每个物种有不同标记形状，使用经典主题
步骤 12：请求 Claude 创建 PCA 图
- 切换到 Terminal
- 输入这个请求：
添加代码对数值变量进行 PCA 分析，并使用前两个主成分绘制样本图。
步骤 13：运行 PCA 分析
- 切换到 RStudio
- 如有提示，重新加载文件
- 选中所有代码，点击 Run
- 出现 PCA 图，显示样本投影到 PC1 和 PC2 上，按物种着色
步骤 14：请求 Claude 审查和注释
- 切换到 Terminal
- 输入这个请求：
检查整个脚本的正确性。必要时添加注释。 - Claude 审查代码并添加全面注释
步骤 15：请求 Claude 创建 R Markdown
- 切换到 Terminal
- 输入这个请求：
为这个分析创建一个新的 R Markdown 文件。保存为 iris_report.Rmd - Claude 请求你的权限来创建此文件
- Claude 在项目文件夹中创建新的
.Rmd文件
步骤 16：编译 R Markdown 文件
- 切换到 RStudio
- 点击 File > Open File…
- 选择
iris_report.Rmd，点击 Open - 点击脚本窗格顶部的 Knit 按钮（毛线球图标）
- RStudio 生成 HTML 报告
- 报告在新窗口打开，显示完整分析和叙述性文本
- HTML 文件保存在项目文件夹中
故障排除
- RStudio 不显示文件更改 - 点击 File > Reopen with Encoding > UTF-8 手动重新加载文件，或关闭并重新打开文件
- “claude: command not found” - 确保完成 安装指南，尝试打开新 Terminal 窗口，或完全关闭 Terminal（Command (⌘) + Q）并重新打开
- 图表未出现 - 确保已安装 ggplot2，如需要在 RStudio Console 中运行
install.packages("ggplot2") - “No such file or directory” - 检查步骤 6 中是否正确输入路径，尝试使用拖放：在输入
cd后（带空格），将 test_claude 文件夹从 Finder 拖到 Terminal - Claude Code 首次请求较慢 - 等待 30-60 秒让 Claude 初始化，后续请求会更快
Mac 键盘快捷键
应用程序之间切换的有用快捷键：
- Command (⌘) + Tab - 在打开的应用程序间快速切换
- Command (⌘) + `（反引号）- 在同一应用程序的窗口间切换
- Command (⌘) + Space - 打开 Spotlight 搜索（打开应用程序）
- Command (⌘) + Q - 完全退出应用程序
下一步
- 请求 Claude 向分析中添加统计检验（t 检验、方差分析）
- 请求 Claude 获取此代码的 Python 版本并准备 Quarto 文档
- 请求 Claude 为 R 脚本中的重复任务创建函数
- 用 Claude 调试 R 代码无法运行时的错误消息
- 探索请求 Claude 优化慢速 R 代码以获得更好性能
工作流总结
这种混合设置结合两个世界的优点：
- RStudio（Mac） - 交互式 R 控制台、即时图表查看、熟悉的 GUI 运行代码
- Claude Code（Terminal） - AI 驱动的代码生成、审查和改进
- 共享文件 - 两个工具都处理 Documents 文件夹中的相同文件
- 迭代优化 - 从手动代码开始，用 Claude 增强，在 RStudio 中测试，进一步优化
- 文档 - Claude 可为分析生成全面报告和注释
工作流简单：在 Terminal 中用 Claude 编写或编辑代码，然后立即在 RStudio 中测试和运行。无需文件复制或手动同步，两个应用程序在 Mac 上无缝访问相同文件。
由 Steven Ge 创建于 2024 年 12 月 11 日。